Ανοιχτά δεδομένα για τον κορονοϊό στην Ελλάδα

Από τις 26 Φεβρουαρίου 2020, όποτε καταγράφηκε το πρώτο κρούσμα κορονοϊού στην Ελλάδα, και εφεξής, το iMEdD Lab συγκεντρώνει τα επίσημα στοιχεία τα οποία δημοσιοποιούνται από τον Εθνικό Οργανισμό Δημόσιας Υγείας (ΕΟΔΥ) και το Υπουργείο Υγείας σχετικά με την εξέλιξη της πανδημίας στη χώρα μας.

Συγκεκριμένα, τα δεδομένα για τα καταγεγραμμένα επιβεβαιωμένα κρούσματα στη χώρα μας, τη γεωγραφική κατανομή αυτών, τον συνολικό και τον ημερήσιο αριθμό θανάτων, και τους διασωληνωμένους ασθενείς ανά ημέρα βασίζονται στα στοιχεία που δημοσιοποιούνται από τον ΕΟΔΥ και το Υπουργείο Υγείας, μέσω:

• των ημερήσιων εκθέσεων επιδημιολογικής επιτήρησης, τις οποίες δημοσιεύει ο ΕΟΔΥ σε αρχεία PDF
• λοιπών ημερήσιων ανακοινώσεων και άτυπων ενημερώσεων από τον ΕΟΔΥ
• των πρακτικών της ενημέρωσης διαπιστευμένων συντακτών του Υπουργείου Υγείας
• της πλατφόρμας covid19.gov.gr

Τα στοιχεία που ανακοινώνονται από τους αρμόδιους φορείς συλλέγονται σε πραγματικό χρόνο και διατηρούνται σε σύνολα δεδομένων (datasets), τα οποία είναι διαθέσιμα στο σχετικό αποθετήριο, στον λογαριασμό του iMEdD Lab στο GitHub. Τα εν λόγω σύνολα δεδομένων ανανεώνονται τουλάχιστον μία φορά την ημέρα και είναι εκείνα τα οποία, επίσης, τροφοδοτούν οποιεσδήποτε αναλύσεις παρουσιάζονται στην εφαρμογή του iMEdD Lab για την εξέλιξη της νόσου COVID-19 στην Ελλάδα.  

Στο παραπάνω dataset, οι τιμές της στήλης «Status» αντιστοιχούν σε διαφορετικά μεγέθη (μεταβλητές) όσον αφορά στην εξέλιξη της πανδημίας στη χώρα, όπως περιγράφονται παρακάτω.

• cases: νέα επιβεβαιωμένα κρούσματα τα οποία ανακοινώθηκαν την εκάστοτε ημέρα αναφοράς. Σε συγκεκριμένες ημερομηνίες, ο αριθμός των ημερήσιων κρουσμάτων που παρουσιάζεται στο παραπάνω σύνολο δεδομένων είναι διαφορετικός από εκείνον ο οποίος έχει ανακοινωθεί στην έκθεση επιδημιολογικής επιτήρησης που δημοσίευσε ο ΕΟΔΥ την ίδια ημέρα. Αυτή η ανακολουθία συμβαίνει, επειδή ο ΕΟΔΥ συχνά προβαίνει σε διορθώσεις δεδομένων προγενέστερων ημερομηνιών, αφαιρώντας τυχόν διπλότυπα από τον συνολικό αριθμό κρουσμάτων στη χώρα, χωρίς όμως να γνωστοποιούνται οι ακριβείς ημερομηνίες στις οποίες αντιστοιχούν οι εν λόγω διορθώσεις δεδομένων. Για παράδειγμα, έστω ότι την Ημέρα 2 έχουμε δέκα συνολικά κρούσματα και ότι την Ημέρα 3 ανακοινώνονται πέντε νέα κρούσματα. Ενώ θα περιμέναμε να έχουμε 15 συνολικά κρούσματα στη χώρα την Ημέρα 3, ο ΕΟΔΥ ανακοινώνει ότι υπάρχουν 13 συνολικά κρούσματα ως τότε. Αυτό σημαίνει ότι έχουν εντοπιστεί δύο διπλότυπα, τα οποία αφαιρούνται από τον συνολικό αριθμό κρουσμάτων την Ημέρα 3. Δεδομένου ότι δεν ανακοινώνεται η ημερομηνία καταχώρησης διπλοτύπων (δηλαδή, εάν η εν λόγω διόρθωση δεδομένων αφορά την Ημέρα 1 ή την Ημέρα 2), τρία νέα κρούσματα («cases») παρουσιάζονται την Ημέρα 3 στο dataset μας, ώστε να προκύπτει ο συνολικός αριθμός περιπτώσεων (13 κρούσματα) ο οποίος έχει ανακοινωθεί επισήμως την Ημέρα 3.
• deaths: νέοι θάνατοι ασθενών με COVID-19, που συνέβησαν την εκάστοτε ημερομηνία αναφοράς. Ο αριθμός των ημερήσιων θανάτων συχνά είναι διαφορετικός από εκείνον που έχει ανακοινωθεί από τον ΕΟΔΥ, στην αντίστοιχη ημερήσια έκθεση επιδημιολογικής επιτήρησης. Αυτό συμβαίνει, επειδή στην τελευταία παρουσιάζονται τα νέα δεδομένα που έχουν προκύψει ως τις 15:00 της εκάστοτε ημερομηνίας και εντός 24ωρου από την προηγούμενη έκθεση –δηλαδή, το χρονικό διάστημα αναφοράς της έκθεσης δεν είναι το ημερολογιακό 24ωρο, αλλά οι τελευταίες 24 ώρες, από τις 15:00 την προηγούμενη ημέρα ως τις 15:00 την ημέρα αναφοράς.   
• recovered: ο συνολικός αριθμός ασθενών οι οποίοι έχουν αναρρώσει ως την εκάστοτε ημερομηνία αναφοράς
• hospitalized: αριθμός νοσηλευομένων ανά ημέρα
• intensive_care: αριθμός ασθενών οι οποίοι νοσηλεύονται σε ΜΕΘ την εκάστοτε ημέρα αναφοράς
• intubated: αριθμός διασωληνωμένων ασθενών ανά ημέρα
• cumulative_rtpcr_tests_raw: ο συνολικός αριθμός των δηλωμένων δειγμάτων που έχουν ελεγχθεί εργαστηριακά και τα οποία έχουν διενεργηθεί ως την εκάστοτε ημερομηνία αναφοράς
• estimated_new_rtpcr_tests: ο εκτιμώμενος αριθμός των δειγμάτων που έχουν ελεγχθεί εργαστηριακά ημερησίως
• cumulative_rapid_tests_raw: o συνολικός αριθμός δειγμάτων που έχουν εξεταστεί στο πλαίσιο ελέγχων Rapid Ag που έχουν γίνει από μονάδες υγείας και κλιμάκια του ΕΟΔΥ ως την αντίστοιχη ημερομηνία
• estimated_new_rtpcr_tests: ο εκτιμώμενος αριθμός ημερήσιων δειγμάτων που έχουν εξεταστεί στο πλαίσιο ελέγχων Rapid Ag
• estimated_new_total_tests: ο εκτιμώμενος συνολικός αριθμός ημερήσιων τεστ, περιλαμβανομένων δηλωμένων δειγμάτων τα οποία έχουν ελεγχθεί εργαστηριακά και δειγμάτων τα οποία έχουν εξεταστεί στο πλαίσιο ελέγχων Rapid Ag. Ο ημερήσιος αριθμός τεστ υπολογίζεται δευτερογενώς από το iMEdD Lab, αφαιρώντας τον προηγουμένως γνωστό συνολικό αριθμό τεστ από τον συνολικό αριθμό τεστ που ανακοινώνεται την τρέχουσα ημέρα κάθε φορά. Σε συγκεκριμένες ημερομηνίες, ο συνολικός αριθμός τεστ που έχουν γίνει αθροιστικά έως τότε δεν έχει ανακοινωθεί από τους αρμόδιους φορείς. Σε αυτές τις περιπτώσεις, ο εκτιμώμενος ημερήσιος αριθμός τεστ υπολογίζεται διαιρώντας το αποτέλεσμα της παραπάνω αφαίρεσης με τον αριθμό των ημερών που έχουν μεσολαβήσει ανάμεσα στους δύο τελευταίους συνολικούς αριθμούς τεστ οι οποίοι έχουν ανακοινωθεί. Τότε, ο εκτιμώμενος ημερήσιος αριθμός τεστ αντιστοιχεί στον ημερήσιο μέσο όρο των συνολικών τεστ που έχουν διεξαχθεί εντός συγκεκριμένου χρονικού διαστήματος.
• total cases: o συνολικός αριθμός επιβεβαιωμένων κρουσμάτων στη χώρα ως την εκάστοτε ημέρα αναφοράς

Ελλείπουσες παρατηρήσεις (κενές τιμές), όπου υπάρχουν στο σύνολο δεδομένων, σημαίνουν ότι τα αντίστοιχα στοιχεία δεν έχουν δημοσιευθεί από τους αρμόδιους φορείς.